Тәуекелдерді басқару жүйесі тәуекелдерді бағалауға негізделген және тәуекелдерді анықтау және алдын-алу үшін салық органдары әзірлеген және / немесе қолданатын шараларды қамтиды.

            Тәуекел - салық төлеушінің (салық агентінің) салық міндеттемесін орындамау және (немесе) толық орындамауы ықтималдығы, ол мемлекетке зиян келтіруі мүмкін және / немесе мүмкін.

            Тәуекелдерді басқару жүйесінің салық органдарының қолдану мақсаттары:

1) қатер төнген аудандарға назар аудару және қолда бар ресурстарды неғұрлым тиімді пайдалануды қамтамасыз ету;

2) салық салу саласындағы құқық бұзушылықтарды анықтау мүмкіндіктерінің ұлғаюы;

3) тәуекел дәрежесінің төмендігі анықталатын салық төлеушілерге (салық агенттеріне) қатысты салықтық бақылауды азайту.

            Салық органы салық төлеушілер (салық агенттері) ұсынған салық есептілігінің деректерін, уәкілетті мемлекеттік органдардан, жергілікті атқарушы органдардан, уәкілетті тұлғалардан алынған ақпараттарды, сондай-ақ салық төлеушінің қызметі туралы (салық агенті) өзге де құжаттарды және (немесе) ақпаратты талдайды.

            Осы талдаудың нәтижелері бойынша салық органдары:

салық төлеушілерді (салық агенттерін) олардың қызметін төмен, орташа немесе жоғары тәуекел ретінде жіктеу арқылы жіктеу;

Салық кодексінде белгіленген жағдайларда салықтық әкімшілік шараларды дифференциалды қолдану.

            Тәуекелдерді басқару жүйесі Салық кодексінде көзделген жағдайларда салықтық әкімшілендіруді жүзеге асыру кезінде қолданылады.

            Тәуекелдерді басқару жүйесі тәуекелдерді басқарудың ақпараттық жүйесі арқылы іске асырылуы мүмкін.

            Тәуекел дәрежесі бойынша критерийлер салық төлеушілерді (салық агенттерін) бағалайтын ерекшеліктер жиынтығы болып табылады және оларды тәуекелдер деңгейіне қарай жіктейді. 

            Тәуекелдер критерийлері келесі критерийлерді қоспағанда, құпия ақпарат болып табылады:

салық ауыртпалығы;

бір қызметкердің орташа айлық жалақысы;

салық есептілігінде көрсетілген шығыстар мен кірістердің сомасы;

қосылған құн салығы бойынша есепке алудан алынатын тұлғалармен, соның ішінде таратылған, белсенді емес, банкроттықпен өзара есеп айырысатын салық төлеушілермен жасалатын операциялар;

            бірнеше салық кезеңдеріндегі шығындарды салық есептілігінде көрсету;

            бұрын ұсынылған салық есептілігіне енгізілген өзгерістер мен толықтырулар;

            Камералдық бақылау нәтижелерімен анықталған бұзушылықтар;

            Салық кодексінде белгіленген көрсеткіштердің шекті мәніне қайтадан жуықтау, арнаулы салық режимдерін қолдану құқығын беру;

тәуекелді азайтатын критерийлер;

уәкілетті органмен кәсіпкерлік жөніндегі уәкілетті органмен бірлесіп бекітілген критерийлер;

қосылған құн салығының асып кету сомасының сенімділігін растау үшін өлшемдер.

            Қоса алғанда қосылған құн салығының сомасының сенімділігін растау үшін тәуекел дәрежесін бағалау критерийлерін және тәуекелдерді басқару жүйесін қолдану тәртібін уәкілетті орган айқындайды.
            Қоса алғанда қосылған құн салығы сомасының дұрыстығын растау мақсатында тәуекел дәрежесін бағалау критерийін және тәуекелдерді басқару жүйесін қолдану тәртібін қоспағанда, құпия ақпарат болып табылмайтын критерийлерді ескере отырып, тәуекелдерді басқару жүйесін қолдану тәртібін уәкілетті орган айқындайды және басқа мәселелер бойынша:               1) тәуекел дәрежесі критерийлері бойынша көрсеткіштер; 

            2) салық төлеушiлердi сыныптау нәтижелерi туралы ақпараттандырудың тәртiбi мен мерзiмдерi; 

            3) салық төлеушiге осындай салық төлеушiнiң қызметi тиiстi тәуекел дәрежесiмен байланысты өлшемдер туралы хабарлаудың тәртiбi мен мерзiмдерi; 

            4) тәуекел дәрежесі туралы ақпаратты жаңарту жиілігі